有名な魔法使いが所有するお店で働き、スキルアップを目指している少女カチャ。そんなある日、いつもどおりに出勤したら…なんと魔法使いが行方不明に！薬を買いにやってくるお客さんたちの相手をひとりでこなすことになってしまったカチャのお手伝いをしてあげよう。ファンタジーあふれるアイテムのアップグレードや、風変わりなお客さんの好みを学んで、お店の評判を落とさないよう頑張って！薬作りを学びながら、こつぜんと姿を消してしまった魔法使いを探す手がかりも集めていこう。果たして無事に再会できるのか！？ - 魔法少女カチャ：消えた魔法使いの謎

• 薬作りの道具をアップグレード
• 個性あふれる来店客たち
• 魔法使いの行方を調べよう